Openbaar onderwijs kenmerkt zich ook door een democratisch bestuur. Er is daarom een actieve rol binnen de SPO voor de medezeggenschapsraad (MR). Vanaf 1992 is de medezeggenschap in het onderwijs bij wet geregeld. De wet bepaalt dat er aan iedere school een medezeggenschapsraad verbonden is. De raad, meestal kortweg MR genoemd, bestaat uit leden die door het personeel worden gekozen en leden die door de ouders gekozen worden. De MR heeft inspraak op schoolbeleid t.a.v. onderwijs, personeel, leerlingen en financiën. Beleidsvoorstellen worden door de directeur aan de MR ter inspraak voorgelegd.
Voor bovenschools beleid is er een Gemeenschappelijke Medezeggenschaps Raad (GMR)